3.2. Vinuté cievky sa vytvoria keď sa dva alebo viac α-helixov samozostaví navinutím okolo seba a vytvoria ľavotočivú supercievku (obr. 3.1C). Hoci diméry, triméry a tetraméry sú najbežnejšími štruktúrami, teraz možno normatívne navrhnúť väčšie stočené špirály až do siedmich helixov [8].
Kde sa nachádzajú stočené cievky?
Coiled-coil sa nachádza v proteínoch vo všetkých troch kráľovstvách života. Coiled-coil domény niektorých proteínov sú takmer invariantné v sekvencii a dĺžke, čím prezrádzajú štrukturálnu a funkčnú úlohu aminokyselín po celej dĺžke coiled-coil.
Ako sa stočené zvitky držia pohromade?
Zvinutá špirála alebo superhelix vzniká zvinutím dvoch, troch alebo štyroch α-závitníc. Špirálové vlákna sú držané pohromade hydrofóbnou silou vytvorenou medzi nepolárnymi bočnými reťazcami z rôznych peptidových vlákien.
Čo je to špirálová štruktúra?
Zvinuté zvitky sú α-helikálne štruktúry, v ktorých sú špirály navinuté okolo seba a vytvárajú superhelikálne zväzky. Zvyčajne pozostávajú z dvoch alebo troch špirál v paralelnej alebo antiparalelnej orientácii, ale boli určené štruktúry so siedmimi a viacerými špirálami.
Je rozdiel medzi špirálou a cievkou?
Helix je sekundárna štruktúra a stočená špirála je supersekundárna štruktúra, ale obe sú výsledkom interaktívnych síl medzi susednými aminokyselinovými zvyškami okolo peptidovej väzby.