1.1 α-Helices. α-helix je bežný prvok sekundárnej štruktúry proteínu, ktorý sa tvorí keď sa aminokyseliny „navíjajú“a vytvárajú pravotočivú špirálu, kde bočné reťazce smerujú z centrálnej cievky (Obr. 3.1A, B).
Čo spôsobuje tvorbu alfa helixov?
Alfa helix sa vyznačuje pevným pravotočivým zákrutom v reťazci aminokyselín, ktorý spôsobuje, že tvorí tyčinkový tvar. Vodíkové väzby medzi vodíkom v aminoskupine a kyslíkom v karboxylovej skupine na aminokyseline spôsobujú túto štruktúru.
Ako sa tvoria alfa helixy a beta listy?
Alfa helix sa tvorí, keď sa polypeptidové reťazce skrútia do špirály To umožňuje všetkým aminokyselinám v reťazci vytvárať vodíkové väzby medzi sebou.… Beta skladaný list sú polypeptidové reťazce prebiehajúce vedľa seba. Kvôli vlnitému vzhľadu sa nazýva plisovaná plachta.
Aké aminokyseliny tvoria helixy?
Rôzne aminokyselinové sekvencie majú rôzne sklony k tvorbe α-helikálnej štruktúry. Metionín, alanín, leucín, glutamát a lyzín bez náboja ("MALEK" v 1-písmenových kódoch aminokyselín) všetky majú obzvlášť vysoké sklony k tvorbe špirály, zatiaľ čo prolín a glycín majú slabé sklony k tvorbe špirály.
Ako vzniká sekundárna proteínová štruktúra z primárnej?
Primárna štruktúra proteínu je definovaná výlučne jeho aminokyselinovou sekvenciou a je konštruovaná pomocou peptidových väzieb medzi susednými aminokyselinovými zvyškami. Sekundárna štruktúra je výsledkom vodíkovej väzby pozdĺž polypeptidovej kostry, čo vedie k alfa-helixom a beta-skladaným listom.
