SDS sa silne viaže na kladne nabité a hydrofóbne zvyšky bielkovín prostredníctvom svojich sulfátových skupín a alkylových reťazcov 13 V súlade s tým, je to cenný detergent v oblasti štrukturálnej biológie a štúdií skladania/rozbaľovania proteínov.
Čo robí SDS s proteínom?
SDS je amfipatická povrchovo aktívna látka. denaturuje proteíny väzbou na proteínový reťazec s jeho uhľovodíkovým chvostom, odhaľuje normálne skryté oblasti a pokrýva proteínový reťazec molekulami povrchovo aktívnej látky. Polárna hlavová skupina SDS pridáva k použitiu tohto denaturačného činidla ďalšiu výhodu.
Ako sa SDS viaže na aminokyseliny?
SDS má hydrofóbny koniec, ktorý silne interaguje s proteínovými (polypeptidovými) reťazcami. Počet molekúl SDS, ktoré sa viažu na proteín, je úmerný počtu aminokyselín, ktoré tvoria proteín Každá molekula SDS prispieva dvoma negatívnymi nábojmi, ktoré prevyšujú akýkoľvek náboj, ktorý proteín môže mať.
Pokrýva SDS proteíny?
SDS tiež pokrýva proteín jednotným záporným nábojom, ktorý maskuje vnútorné náboje na R-skupinách. SDS sa viaže pomerne rovnomerne na lineárne proteíny (okolo 1,4 g SDS/1 g proteínu), čo znamená, že náboj proteínu je teraz približne úmerný jeho molekulovej hmotnosti.
Ako SDS dáva proteínu záporný náboj?
SDS je detergent, ktorý obsahuje dlhý alifatický reťazec a sulfátovú skupinu. Tento detergent interaguje s denaturovanými proteínmi a vytvára silne negatívne nabitý komplex (záporný náboj vznikajúci z SO42 − skupín KBÚ). Proteíny sa najskôr denaturujú teplom a potom sa vo veľkom nadbytku pridá SDS.
