BigWig je formát súboru na zobrazenie hustých súvislých údajov v stope prehliadača genómu, vytvorený konverziou z formátu Wiggle (WIG). Formát BigWig je opísaný na webovej stránke UCSC Genome Bioinformatics a sprievodca formátom súborov Broad Institute poskytuje ďalšie informácie.
Čo je formát bigWig?
Formát bigWig je pre zobrazenie hustých, súvislých údajov, ktoré sa zobrazia ako graf Súbory BigWig sú pôvodne vytvorené zo súborov typu WIG pomocou programu UCSC wigToBigWig. Alternatívne môžu byť súbory bigWig vytvorené zo súborov bedGraph pomocou programu UCSC bedGraphToBigWig.
Ako môžem použiť súbor bigWig?
Presuňte novovytvorený súbor bigWig (myBigWig.bw) na webovú adresu http, https alebo ftp. Prilepte adresu URL do formulára na zadanie vlastnej stopy alebo vytvorte vlastnú stopu pomocou jednej čiary stopy. Prilepte riadok vlastnej stopy do textového poľa na stránke správy vlastnej stopy.
Čo je skladba bigWig?
bigWig Tracks sú stopy pre nepretržité signály naprieč celým genómom. Sú vhodné na zobrazenie rôznych „surových“výsledkov experimentov, ako sú signály ChIP-Seq, signály RNA-Seq atď.
Ako vytvorím súbor bigWig?
Existuje viacero spôsobov, ako generovať veľké súbory. Zvyčajne to zahŕňa konverziu súboru. bam súbor na trasúcu sa stopu (.wig) a následnú konverziu chvenia stopy na binárny bigwig (.
