Logo sk.boatexistence.com

Ako sa robí metagenomika?

Obsah:

Ako sa robí metagenomika?
Ako sa robí metagenomika?

Video: Ako sa robí metagenomika?

Video: Ako sa robí metagenomika?
Video: The Voice Kids Philippines 2015 Blind Audition: "Sa Mata Makikita" by Jeomar 2024, Smieť
Anonim

Metagenomika je definovaná ako priama genetická analýza genómov obsiahnutých v environmentálnej vzorke Táto oblasť pôvodne začala klonovaním environmentálnej DNA, po ktorej nasledoval funkčný skríning expresie [1], a potom bol rýchlo doplnený priamym náhodným sekvenovaním environmentálnej DNA [2, 3].

Aký je proces metagenomiky?

Metagenomika zahŕňa získavanie DNA zo všetkých mikroorganizmov v rámci komunity bez nevyhnutnej identifikácie všetkých príslušných druhov. Po sekvenovaní génov a ich porovnaní s identifikovanými sekvenciami je možné určiť funkcie týchto génov.

Aká technika sa používa v metagenomike?

Vzorka mikrobiálnej komunity sa odoberá z morskej vody, sedimentu, hostiteľského zvieraťa alebo iného morského prostredia. Zozbierané bunky sa potom lyzujú a z ich lyzátu sa extrahuje DNA. Technika, ktorá umožňuje metagenomiku, je shotgun sekvenovanie, ktorá sekvenuje náhodné oblasti DNA necieleným spôsobom.

Aké sú 3 kroky k štúdiu metagenomiky?

Kroky a proces metagenomiky:

  1. Ukážková kolekcia:
  2. extrakcia DNA:
  3. Príprava vzorky:
  4. Analýza vzorky:

Ako sa vykonáva funkčná metagenomika?

Funkčná metagenomika zahŕňa izoláciu DNA z mikrobiálnych spoločenstiev na štúdium funkcií kódovaných proteínov. Zahŕňa klonovanie fragmentov DNA, expresiu génov v náhradnom hostiteľovi a skríning enzymatických aktivít.

Odporúča: