Trypsín štiepi peptidovú väzbu medzi karboxylovou skupinou arginínu alebo karboxylovou skupinou lyzínu a aminoskupinou susednej aminokyseliny. Rýchlosť štiepenia prebieha pomalšie, keď lyzínové a arginínové zvyšky susedia s kyslými aminokyselinami v sekvencii alebo cystínom.
Kde trypsín štiepi aminokyseliny?
Trypsín štiepi peptidy na C-terminálnej strane lyzínových a arginínových aminokyselinových zvyškov. Ak je prolínový zvyšok na karboxylovej strane miesta štiepenia, k štiepeniu nedôjde.
Akú sekvenciu reže trypsín?
Trypsín štiepi výhradne C-terminál na zvyšky arginínu a lyzínu Takmer všetky veľké projekty v proteomike založenej na hmotnostnej spektrometrii používajú trypsín na premenu proteínových zmesí na ľahšie analyzovateľný peptid populácie.
Aké aminokyseliny štiepia trypsín a chymotrypsín?
Trypsín redukuje na lyzín a arginín, zatiaľ čo chymotrypsín. reže tyrozín, fenylalanín a tryptofán. Ako enzým vie, že tam má štiepiť? Navrhnite alternatívu pre aspartát a histidín v katalytickej triáde.
Aké aminokyseliny štiepi pepsín?
Pepsín štiepi peptidové väzby na amino-terminálnej strane cyklických aminokyselinových zvyškov ( tyrozín, fenylalanín a tryptofán), čím štiepi polypeptidové reťazce na menšie peptidy (Fange a Grove, 1979).