Väčšina STR sa nachádza v nekódujúcich oblastiach, zatiaľ čo len asi 8 % sa nachádza v kódujúcich oblastiach (3). Okrem toho sa ich hustota medzi chromozómami mierne líši. U ľudí má najvyššiu hustotu STR chromozóm 19 (4). V priemere sa jeden STR vyskytuje na 2 000 bp v ľudskom genóme (5).
Kde nájdem krátke tandemové opakovania?
Separácie DNAPo amplifikácii PCR sa meria celková dĺžka amplikónu STR, aby sa určil počet opakovaní prítomných v každej alele nájdenej v profile DNA. Toto meranie dĺžky sa vykonáva pomocou separácie na základe veľkosti zahŕňajúcej gélovú alebo kapilárnu elektroforézu (CE).
Kde sa nachádzajú tandemové opakovania?
Tandemové opakovania sa vyskytujú v DNA, keď sa vzor jedného alebo viacerých nukleotidov opakuje a tieto opakovania spolu priamo susedia. Niekoľko proteínových domén tiež tvorí tandemové opakovania v rámci ich primárnej aminokyselinovej štruktúry, ako sú napríklad pásavce.
Koľko krátkych tandemových opakovaní existuje?
V roku 1997 Federálny úrad pre vyšetrovanie (FBI) nominoval 13 autozomálne STR lokusy, aby vytvorili jadro kombinovaného systému DNA indexu (CODIS), databázy pozostávajúcej z profilov prispeli federálne, štátne a miestne forenzné laboratóriá.
Majú všetci rovnaké krátke tandemové opakovania?
Skúmanie týchto nekódujúcich oblastí odhaľuje opakované jednotky DNA, ktorých dĺžka sa medzi jednotlivcami líši. Vedci zistili, že jeden konkrétny typ opakovania, známy ako krátke tandemové opakovanie (STR), je relatívne ľahko merateľný a porovnávaný medzi rôznymi jednotlivcami
